据台“外交部”报告指出，对于南海主权问题，台当局秉持“主权在我、搁置争议、和平互惠、共同开发”基本原则，与其他国家和地区共同开发南海资源。台“外交部”表示，对菲律宾宣称黄岩岛为菲律宾不可分割的一部分之领土，且派船舰进入海域进行“执法”措施，这都属于非法行为。
中菲对峙以来，这可说是台湾就南海问题发出的唯一声音，台湾之所以之前保持沉默还是想看大陆的态度行事，事实上，台湾在南海问题上一直和大陆保持着高度一直的心态，但是中间美国夹着，台湾对南海问题也是有气无力，欲言又止，并且台湾的立场因美国这个原因十分不坚定，甚至可以说台湾看美国脸色更比大陆重要，因为已经被美国各方面深入影响的台湾即使现已与大陆逐渐开始融合，仍免不了遵从历史惯性，对美国依然言听计从依赖有加。
一件事情很能说明问题，日本右翼分子石原曾想玩小聪明计划购买钓鱼岛和中国下挑战书，不料台湾看不过去了，对此回应称钓鱼岛是台湾的领土，属于台湾某县管辖，日本甭想打歪主意，可台湾话音未落，美国不高兴了，因为石原的表态无不是美国的授意，台湾狂扁石原无不是对美国大发雷霆，所以美国向台湾问事了，当即对台湾一对夫妇横加指控，说这对夫妇窃取美国的军事情报，台湾坐不住，害怕美国大动肝火立即用行动迎合美国，判处一个间谍无期徒刑，自然这个间谍和大陆有关，所以说来，美国对台湾来说现在还是难以逾越的一堵墙，和大陆走到一起尚需时日。
然而，台湾也并非不想逾越这堵墙，在大陆的照应和关心下，台湾愈来愈感到大陆的重要性和对回归的向往，台湾已逐渐努力在向大陆靠近，当然一时不可能改掉几十年的坏毛病——唯美国是瞻，但是台湾也必须放弃美国，大陆的性格也不是一块软绵，台湾必须有这个心理准备，自从国民党重新回到台湾政界领导地位，这个方向已不可动摇了。那么在看美国的脸色同时，台湾也十分注意大陆的态度，大陆在南海问题和钓鱼岛问题的强硬作风似乎让台湾寻找到了感觉，热血来潮怒发冲冠，不发飙对不起头上中华民族这个光环。
台湾对菲律宾发力其实可能还有另一个因素，那就是美国已彻底在中菲对峙中软化起来，已不可能从行动上支持菲律宾继续与中国对抗，台湾此时对菲律宾发飙既是对大陆相应也是为美国找个空间不丢面子，让菲律宾在南海问题上立马收手。
